Проект Predictor@Home

 

Это один из серии биомедицинских проектов. В ходе расчетов моделируется трехмерная структура белка из последовательностей аминокислот. Целью проекта является проверка и оценка новых алгоритмов и методов предсказания структуры белка и применение этих методов к реальным биологическим целям. Работа проводится при поддержке Центра Предсказания Структуры белка (CASP).

Predictor@Home - был одним из самых нетребовательных к ресурсам проектов. Расчетный модуль занимал около 45 МБ оперативной памяти, принимаемые и отправляемые задания - несколько десятков КилоБайт. Однако разработанные новые расчетные модули оказались очень ресурсоемкими. Проект начал раздавать задания, требующие от 800 до 1200 MBytes памяти. На тот момент немногие компьютеры могли позволить себе подобные расчеты. Все просьбы участников проекта к администрации переработать программу просто игнорировались. Подобное отношение привело к оттоку добровольцев из проекта и он постепенно прекратил свое существование.

В настоящее время по адресу проекта размещена база данных по оболочкам виросов VIPERdb.

 

VIPERdb представляет собой базу данных по икосаэдрическим вирусным структурам капсида (Капсид - это внешняя оболочка вируса, состоящая из белков.). Ресурс акцентируется на предоставлении данных по структурному и компьютерному анализу этих систем, а также на высококачественной визуализации для визуального изучения. Кроме того, все капсиды вирусов помещаются в единой условной (договорной) икосаэдрической ориентации, что содействует сравнению различных структур. Веб-сайт включает в себя мощные утилиты поиска, ссылки на другие соответствующие базы данных, справочную информацию о структуре вирусного капсида, и полезные инструменты интерфейса базы данных.

В базе на данный момент (август 2010 г.) содержится 288 вирусов.

 

  Дополнительная информация о проекте:   

  О проекте Predictor@Home

  Сравнение биомедицинских проектов распределенных вычислений