Описание World Community Grid от Big Blue
Цитата: Удаленный пользователь от 12.10.2019, 15:50World Community Grid
World Community Grid – это глобальное сообщество пользователей ПК, которые предоставляют неиспользуемое время своих вычислительных систем для реализации глобальных исследовательских инициатив (борьбе со СПИдом и онкологическими заболеваниями, моделированию и прогнозированию природных явлений и др.).
Т.е. grid-вычисления – это технология, сводящая вычислительные ресурсы тысяч и миллионов отдельных компьютеров в гигантскую единую «виртуальную» систему с огромной вычислительной мощью.
Глобальный гуманитарный проект World Community Grid запущен IBM в 2004 году при поддержке крупнейших исследовательских центров мира. ИТ-ресурсы World Community Grid позволяют проанализировать за один день такое количество данных, обработка которых на обычном компьютере заняла бы около 130 лет.
На сегодняшний день по всему миру в сети WCG насчитывается 604 494 пользователей, задействовавших 2 175 094 ПК. Общее время вычислений – 661 296 лет.
Для участия в проектах достаточно зарегистрироваться на сайте и загрузить бесплатную программу.
В инфраструктуру World Community Grid могут быть подключены компьютеры, работающие на ОС Windows, Mac и Linux.
После регистрации участник выбирает проект, для которого он хочет предоставить свои компьютерные ресурсы. Проекты отбираются независимым Экспертным советом, в который входят ведущие ученые разных стран.
Присоединившись к сети, пользователь получает на свой компьютер отдельное вычислительное задание (проект разделяется специалистами IBM на миллионы подзадач). Выполнив задание, ПК передает результаты вычислений на сервер и получает новое задание. Вычисления выполняются лишь тогда, когда компьютер не задействован (таким образом участие в проекте не мешает выполнению основных задач). Результаты вычислений, отправленные на сервер, автоматически соединяются с результатами других заданий, и формируют общий результат.
World Community Grid
World Community Grid – это глобальное сообщество пользователей ПК, которые предоставляют неиспользуемое время своих вычислительных систем для реализации глобальных исследовательских инициатив (борьбе со СПИдом и онкологическими заболеваниями, моделированию и прогнозированию природных явлений и др.).
Т.е. grid-вычисления – это технология, сводящая вычислительные ресурсы тысяч и миллионов отдельных компьютеров в гигантскую единую «виртуальную» систему с огромной вычислительной мощью.
Глобальный гуманитарный проект World Community Grid запущен IBM в 2004 году при поддержке крупнейших исследовательских центров мира. ИТ-ресурсы World Community Grid позволяют проанализировать за один день такое количество данных, обработка которых на обычном компьютере заняла бы около 130 лет.
На сегодняшний день по всему миру в сети WCG насчитывается 604 494 пользователей, задействовавших 2 175 094 ПК. Общее время вычислений – 661 296 лет.
Для участия в проектах достаточно зарегистрироваться на сайте и загрузить бесплатную программу.
В инфраструктуру World Community Grid могут быть подключены компьютеры, работающие на ОС Windows, Mac и Linux.
После регистрации участник выбирает проект, для которого он хочет предоставить свои компьютерные ресурсы. Проекты отбираются независимым Экспертным советом, в который входят ведущие ученые разных стран.
Присоединившись к сети, пользователь получает на свой компьютер отдельное вычислительное задание (проект разделяется специалистами IBM на миллионы подзадач). Выполнив задание, ПК передает результаты вычислений на сервер и получает новое задание. Вычисления выполняются лишь тогда, когда компьютер не задействован (таким образом участие в проекте не мешает выполнению основных задач). Результаты вычислений, отправленные на сервер, автоматически соединяются с результатами других заданий, и формируют общий результат.

Цитата: Vladimir Duce HK от 20.11.2019, 21:35Сегодня WCG исполнилось 15 лет
Сегодня WCG исполнилось 15 лет
Цитата: Удаленный пользователь от 21.12.2019, 18:26World Community Grid: сеть распределенных вычислений
Добрый день, уважаемые форумчане!
Задумывались ли Вы когда-нибудь о том, как Вы можете внести свой персональный вклад в борьбу с онкологическими заболеваниями, СПИДом или малярией?
Корпорация IBM предоставляет Grid-технологии для проведения глобальных исследовательских проектов!
World Community Grid
World Community Grid – это глобальное сообщество пользователей ПК, которые предоставляют неиспользуемое время своих вычислительных систем для реализации глобальных исследовательских инициатив (борьбе со СПИдом и онкологическими заболеваниями, моделированию и прогнозированию природных явлений и др.).
Т.е. grid-вычисления – это технология, сводящая вычислительные ресурсы тысяч и миллионов отдельных компьютеров в гигантскую единую «виртуальную» систему с огромной вычислительной мощью.
Глобальный гуманитарный проект World Community Grid запущен IBM в 2004 году при поддержке крупнейших исследовательских центров мира. ИТ-ресурсы World Community Grid позволяют проанализировать за один день такое количество данных, обработка которых на обычном компьютере заняла бы около 130 лет.
На сегодняшний день по всему миру в сети WCG насчитывается 604 494 пользователей, задействовавших 2 175 094 ПК. Общее время вычислений – 661 296 лет.
Для участия в проектах достаточно зарегистрироваться на сайте и загрузить бесплатную программу.
В инфраструктуру World Community Grid могут быть подключены компьютеры, работающие на ОС Windows, Mac и Linux.
После регистрации участник выбирает проект, для которого он хочет предоставить свои компьютерные ресурсы. Проекты отбираются независимым Экспертным советом, в который входят ведущие ученые разных стран.
Присоединившись к сети, пользователь получает на свой компьютер отдельное вычислительное задание (проект разделяется специалистами IBM на миллионы подзадач). Выполнив задание, ПК передает результаты вычислений на сервер и получает новое задание. Вычисления выполняются лишь тогда, когда компьютер не задействован (таким образом участие в проекте не мешает выполнению основных задач). Результаты вычислений, отправленные на сервер, автоматически соединяются с результатами других заданий, и формируют общий результат.
Ниже описание нескольких проектов, в которых можно принять участие.
Computing for clean water/ Вычисления ради чистой воды
Цель проекта заключается в исследовании молекулярных механизмов прохождения воды через углеродные нанотрубки, которые могут стать недорогой и эффективной заменой «начинки» современных фильтров для очистки воды.
Во всем мире более 1,2 млрд. людей не имеют доступа к чистой питьевой воде, а 2,6 млрд. не имеют в жилищах канализации. В результате этих проблем ежегодно расстаются с жизнью миллионы людей. Проблема усугубляется относительной дороговизной технологий фильтрации загрязненной воды, особенно для социально незащищенных слоев населения. Опреснение морской воды — еще менее доступная вещь, хотя потенциально способная решить проблему с питьевой водой во многих регионах.
На мощностях WCG планируется провести всестороннее молекулярное моделирование динамики движения и взаимодействия молекул воды с нанотрубками.
Компьютерное моделирование поможет, в частности, внести ясность в вопрос о необычном поведении молекул воды при контакте с нанотрубками, когда вода начинает вести себя как лед. Разобравшись с этой проблемой, можно добиться минимального сопротивления молекул воды при прохождении через нанотрубки и другие нанопористые материалы, и, таким образом, — увеличить скорость очистки воды.
Discovering Dengue Drugs – Together/ Поиск лекарств от лихорадки
Проект призван обнаружить потенциальные лекарственные соединения, которые блокируют размножение в организме человека вирусов семейства Flaviviridae. К ним относятся вирусы, вызывающие такие опасные заболевания, как лихорадка Денге, желтая лихорадка, лихорадка Западного Нила, гепатит С и пр.
Около 40% населения Земли проживают в регионах, где высока вероятность заразиться одним из перечисленных вирусов. К сожалению, эффективных препаратов для лечения этих заболеваний не существует, а паллиативная терапия обходится слишком дорого и при этом способна лишь ненамного снизить показатели летальности среди больных.
В рамках проекта Discovering Dengue Drugs – Together ученые делают ставку на поиск ингибиторов вирусной протеазы NS3.
В августе 2009 года закончилась первая фаза проекта. Вычисления проводились с помощью специализированной программы для молекулярного докинга – AutoDock, разработанной доктором Олсоном и его сотрудниками из Научно-исследовательского института Скриппса.
В ходе вычислений было произведено моделирование взаимодействия с протеазой NS3 около 3 млн потенциально эффективных малых молекул, из которых было отобрано несколько тысяч самых перспективных. Но, к сожалению, 90-95% соединений оказались неэффективными в лабораторных условиях.
На второй фазе проекта Discovering Dengue Drugs – Together планируется отсеять ложноположительные соединения, найденные в первой фазе, с помощью еще одной программы для молекулярного докинга – CHARMM, разработанной Мартином Карплюсом и его сотрудниками в Гарварде.
Для начала: Зарегистрируйтесь в World Community Grid и загрузите клиент BOINC.Help Conquer Cancer
Миссия проекта заключается в том, чтобы улучшить результаты исследований белков методом рентгеновской кристаллографии (X-ray Crystallography), что поможет исследователям понять, как образуется рак, как он развивается, и как на него можно повлиять.
Для того чтобы существенным образом повлиять на понимание рака и на его лечение, нужно не только открыть новые терапевтические подходы, нацеленные на исследование метастаз (процесс распространения рака на другие органы тела), но и найти некие маркеры или структурные метки, с помощью которых можно было бы провести раннюю диагностику.
Во время изучения многих форм рака, исследователи смогли сделать несколько открытий, имея ограниченное представление об участвующих в образовании рака белках. Но для того, чтобы глубже понять и найти более эффективные способы лечения, необходимо исследовать все вовлеченные в процесс белки, их структуру и функции.
С помощью рентгеновской кристаллографии исследователи смогут получить более точные данные о структуре этих белков. Это должно привести к более глубокому пониманию функций ракообразующих белков, и позволит найти потенциальные лекарства от смертельной болезни.
В проекте обрабатывается более 105 млн. изображений.
С подробной информацией по всем проектам можно познакомиться на сайте World Community Grid.
Глобальное сотрудничество и партнерство
IBM ставит задачу расширения сети World Community Grid путем привлечения новых участников из разных стран.
В России на данный момент насчитывается 3 603 участника, задействовавших 21 717 компьютеров. Общее время вычислений – 5 656 лет.
Помимо новых участников IBM ищет исследовательские проекты из России для предоставления grid-технологий.
Предпочтение отдается проектам, связанным с изучением и охраной окружающей среды. Это может быть моделирование стихийных явлений, природных катастроф, изменений климата, оценка запасов природных ресурсов, охрана и восстановление ландшафтов и т.д. Критерии для отбора проектов – научная значимость, глобальный характер проблемы и возможность разделить задачу на множество подзадач.
Исследователи, заинтересованные в использовании ресурсов WCG для выполнения своих проектов, могут получить консультацию по адресу: [email protected]. Заявки на участие в проекте оформляются на сайте World Community Grid.
По самым скромным оценкам проектам в среднем необходимо 184 тысячи лет процессорного времени, а если брать по максимуму – в 10-100 раз больше.
Но сколько бы в итоге ни понадобилось вычислительных ресурсов, можно с уверенностью сказать — не поставлена еще такая задача, с которой бы не справилась многомиллионная добровольческая армия владельцев персональных компьютеров, жертвующих свои кровные гигагерцы и киловатты во имя науки
Желаете поучаствовать? Тогда подключайтесь к World Community Grid, чтобы сделать мир чуточку лучше!
http://forum.boinc.ru/default.aspx?g=mytopics
http://boinc.berkeley.edu/download.php
http://www.boinc.ru/doc/boinc/boinc_setup.htm
World Community Grid: сеть распределенных вычислений
Добрый день, уважаемые форумчане!
Задумывались ли Вы когда-нибудь о том, как Вы можете внести свой персональный вклад в борьбу с онкологическими заболеваниями, СПИДом или малярией?
Корпорация IBM предоставляет Grid-технологии для проведения глобальных исследовательских проектов!
World Community Grid
World Community Grid – это глобальное сообщество пользователей ПК, которые предоставляют неиспользуемое время своих вычислительных систем для реализации глобальных исследовательских инициатив (борьбе со СПИдом и онкологическими заболеваниями, моделированию и прогнозированию природных явлений и др.).
Т.е. grid-вычисления – это технология, сводящая вычислительные ресурсы тысяч и миллионов отдельных компьютеров в гигантскую единую «виртуальную» систему с огромной вычислительной мощью.
Глобальный гуманитарный проект World Community Grid запущен IBM в 2004 году при поддержке крупнейших исследовательских центров мира. ИТ-ресурсы World Community Grid позволяют проанализировать за один день такое количество данных, обработка которых на обычном компьютере заняла бы около 130 лет.
На сегодняшний день по всему миру в сети WCG насчитывается 604 494 пользователей, задействовавших 2 175 094 ПК. Общее время вычислений – 661 296 лет.
Для участия в проектах достаточно зарегистрироваться на сайте и загрузить бесплатную программу.
В инфраструктуру World Community Grid могут быть подключены компьютеры, работающие на ОС Windows, Mac и Linux.
После регистрации участник выбирает проект, для которого он хочет предоставить свои компьютерные ресурсы. Проекты отбираются независимым Экспертным советом, в который входят ведущие ученые разных стран.
Присоединившись к сети, пользователь получает на свой компьютер отдельное вычислительное задание (проект разделяется специалистами IBM на миллионы подзадач). Выполнив задание, ПК передает результаты вычислений на сервер и получает новое задание. Вычисления выполняются лишь тогда, когда компьютер не задействован (таким образом участие в проекте не мешает выполнению основных задач). Результаты вычислений, отправленные на сервер, автоматически соединяются с результатами других заданий, и формируют общий результат.
Ниже описание нескольких проектов, в которых можно принять участие.
Computing for clean water/ Вычисления ради чистой воды
Цель проекта заключается в исследовании молекулярных механизмов прохождения воды через углеродные нанотрубки, которые могут стать недорогой и эффективной заменой «начинки» современных фильтров для очистки воды.
Во всем мире более 1,2 млрд. людей не имеют доступа к чистой питьевой воде, а 2,6 млрд. не имеют в жилищах канализации. В результате этих проблем ежегодно расстаются с жизнью миллионы людей. Проблема усугубляется относительной дороговизной технологий фильтрации загрязненной воды, особенно для социально незащищенных слоев населения. Опреснение морской воды — еще менее доступная вещь, хотя потенциально способная решить проблему с питьевой водой во многих регионах.
На мощностях WCG планируется провести всестороннее молекулярное моделирование динамики движения и взаимодействия молекул воды с нанотрубками.
Компьютерное моделирование поможет, в частности, внести ясность в вопрос о необычном поведении молекул воды при контакте с нанотрубками, когда вода начинает вести себя как лед. Разобравшись с этой проблемой, можно добиться минимального сопротивления молекул воды при прохождении через нанотрубки и другие нанопористые материалы, и, таким образом, — увеличить скорость очистки воды.
Discovering Dengue Drugs – Together/ Поиск лекарств от лихорадки
Проект призван обнаружить потенциальные лекарственные соединения, которые блокируют размножение в организме человека вирусов семейства Flaviviridae. К ним относятся вирусы, вызывающие такие опасные заболевания, как лихорадка Денге, желтая лихорадка, лихорадка Западного Нила, гепатит С и пр.
Около 40% населения Земли проживают в регионах, где высока вероятность заразиться одним из перечисленных вирусов. К сожалению, эффективных препаратов для лечения этих заболеваний не существует, а паллиативная терапия обходится слишком дорого и при этом способна лишь ненамного снизить показатели летальности среди больных.
В рамках проекта Discovering Dengue Drugs – Together ученые делают ставку на поиск ингибиторов вирусной протеазы NS3.
В августе 2009 года закончилась первая фаза проекта. Вычисления проводились с помощью специализированной программы для молекулярного докинга – AutoDock, разработанной доктором Олсоном и его сотрудниками из Научно-исследовательского института Скриппса.
В ходе вычислений было произведено моделирование взаимодействия с протеазой NS3 около 3 млн потенциально эффективных малых молекул, из которых было отобрано несколько тысяч самых перспективных. Но, к сожалению, 90-95% соединений оказались неэффективными в лабораторных условиях.
На второй фазе проекта Discovering Dengue Drugs – Together планируется отсеять ложноположительные соединения, найденные в первой фазе, с помощью еще одной программы для молекулярного докинга – CHARMM, разработанной Мартином Карплюсом и его сотрудниками в Гарварде.
Для начала: Зарегистрируйтесь в World Community Grid и загрузите клиент BOINC.
Help Conquer Cancer
Миссия проекта заключается в том, чтобы улучшить результаты исследований белков методом рентгеновской кристаллографии (X-ray Crystallography), что поможет исследователям понять, как образуется рак, как он развивается, и как на него можно повлиять.
Для того чтобы существенным образом повлиять на понимание рака и на его лечение, нужно не только открыть новые терапевтические подходы, нацеленные на исследование метастаз (процесс распространения рака на другие органы тела), но и найти некие маркеры или структурные метки, с помощью которых можно было бы провести раннюю диагностику.
Во время изучения многих форм рака, исследователи смогли сделать несколько открытий, имея ограниченное представление об участвующих в образовании рака белках. Но для того, чтобы глубже понять и найти более эффективные способы лечения, необходимо исследовать все вовлеченные в процесс белки, их структуру и функции.
С помощью рентгеновской кристаллографии исследователи смогут получить более точные данные о структуре этих белков. Это должно привести к более глубокому пониманию функций ракообразующих белков, и позволит найти потенциальные лекарства от смертельной болезни.
В проекте обрабатывается более 105 млн. изображений.
С подробной информацией по всем проектам можно познакомиться на сайте World Community Grid.
Глобальное сотрудничество и партнерство
IBM ставит задачу расширения сети World Community Grid путем привлечения новых участников из разных стран.
В России на данный момент насчитывается 3 603 участника, задействовавших 21 717 компьютеров. Общее время вычислений – 5 656 лет.
Помимо новых участников IBM ищет исследовательские проекты из России для предоставления grid-технологий.
Предпочтение отдается проектам, связанным с изучением и охраной окружающей среды. Это может быть моделирование стихийных явлений, природных катастроф, изменений климата, оценка запасов природных ресурсов, охрана и восстановление ландшафтов и т.д. Критерии для отбора проектов – научная значимость, глобальный характер проблемы и возможность разделить задачу на множество подзадач.
Исследователи, заинтересованные в использовании ресурсов WCG для выполнения своих проектов, могут получить консультацию по адресу: [email protected]. Заявки на участие в проекте оформляются на сайте World Community Grid.
По самым скромным оценкам проектам в среднем необходимо 184 тысячи лет процессорного времени, а если брать по максимуму – в 10-100 раз больше.
Но сколько бы в итоге ни понадобилось вычислительных ресурсов, можно с уверенностью сказать — не поставлена еще такая задача, с которой бы не справилась многомиллионная добровольческая армия владельцев персональных компьютеров, жертвующих свои кровные гигагерцы и киловатты во имя науки
Желаете поучаствовать? Тогда подключайтесь к World Community Grid, чтобы сделать мир чуточку лучше!
http://forum.boinc.ru/default.aspx?g=mytopics
http://boinc.berkeley.edu/download.php
http://www.boinc.ru/doc/boinc/boinc_setup.htm

Цитата: Pavel Kirpichenko от 06.01.2020, 19:43У меня boinc-клиент почему-то не видит учетную запись проекта.
У меня boinc-клиент почему-то не видит учетную запись проекта.
Цитата: Евгений от 08.01.2020, 13:16Цитата: Pavel Kirpichenko от 06.01.2020, 19:43У меня boinc-клиент почему-то не видит учетную запись проекта.
проект перешел от авторизации по логину на атворизацию по электронной почте, успели отразить эти изменения?
кроме того с конца осени активно вычищались старые неактивные аккаунты, точные критерии можно найти на их форуме. из 500+ тыс учетных записей осталось 140 тыс.
Цитата: Pavel Kirpichenko от 06.01.2020, 19:43У меня boinc-клиент почему-то не видит учетную запись проекта.
проект перешел от авторизации по логину на атворизацию по электронной почте, успели отразить эти изменения?
кроме того с конца осени активно вычищались старые неактивные аккаунты, точные критерии можно найти на их форуме. из 500+ тыс учетных записей осталось 140 тыс.

Цитата: Pavel Kirpichenko от 10.01.2020, 13:49Цитата: Евгений от 08.01.2020, 13:16Цитата: Pavel Kirpichenko от 06.01.2020, 19:43У меня boinc-клиент почему-то не видит учетную запись проекта.
проект перешел от авторизации по логину на атворизацию по электронной почте, успели отразить эти изменения?
Мне на эл. почту пришло письмо с запросом на активацию. Я активировал. Но боинк не видит мой профиль. Что может быть?
У меня boinc-клиент почему-то не видит учетную запись проекта.
проект перешел от авторизации по логину на атворизацию по электронной почте, успели отразить эти изменения?
Мне на эл. почту пришло письмо с запросом на активацию. Я активировал. Но боинк не видит мой профиль. Что может быть?

Цитата: prb от 21.01.2020, 18:39В последнее время приходят задания только подпроектов Microbiome Immunity Project и Mapping Cancer Markers. У всех так?
В последнее время приходят задания только подпроектов Microbiome Immunity Project и Mapping Cancer Markers. У всех так?

Цитата: Удаленный пользователь от 22.01.2020, 12:57у меня тоже...
у меня тоже...
Цитата: Удаленный пользователь от 12.02.2020, 17:43Ну, если ни кто не против то я буду постить переводные гуглом статьи, во все темы которые они относятся...
вот очередная статья...
Команда World Community Grid's FightAIDS @ Home собралась на совещании Центра HIVE
Автор: исследовательская группа FightAIDS @ Home
Резюме 11 февраля 2020 г.
Исследователи FightAIDS @ Home недавно встретились в Калифорнии, чтобы обсудить свои планы на будущее проекта.
15 и 16 января 2020 года Центр ВИЧE (ВИЧ-взаимодействия в процессе вирусной эволюции) провел свою ежегодную зимнюю встречу лицом к лицу в Ла-Холье, штат Калифорния, в Исследовательском институте Скриппса. Шестьдесят пять ученых, являющихся членами HIVE со всей страны, присутствовали. Этот финансируемый Национальным институтом здравоохранения США центр был основан директором-основателем профессором Артуром Олсоном, который также инициировал проект FightAIDS @ Home (FAAH) по сетке World Community Grid (WCG) в 2005 году. FAAH и WCG играют важную роль в работе Центра, который объединяет их вычислительные исследования с экспериментальными исследованиями вирусологов, молекулярных биологов, структурных биологов и химиков в рамках HIVE.
На собрании было представлено последнее исследование группы FAAH, в которое вошли работы группы Леви из Университета Темпл, а также лаборатории Олсона в Исследовательском институте Скриппса.
Группа Леви описала текущие вычисления, которые они делают, чтобы найти новые лекарственные препараты-кандидаты. Они используют World Community Grid для оценки и ранжирования соединений, которые были ранее идентифицированы путем виртуального скрининга на молекулу капсида и его сборки. Капсид является новой мишенью ВИЧ для разработки лекарств, и эта новая мишень имеет решающее значение в процессе вирусной инфекции.
Группа Олсона описала новые предварительные виртуальные экраны против капсида, которые могут создавать «ингибиторы самоубийства», соединения, химически связанные с целевым белком. В этом подходе используется химия, разработанная для члена HIVE и лауреата Нобелевской премии Барри Шарплса в Scripps. Обсуждались планы запуска новой виртуальной кампании скрининга с использованием этой химии против капсида на FightAIDS @ HOME.
На двухдневной встрече была освещена последняя работа HIVE по пониманию структуры и функции ВИЧ и того, как инфицированные клетки человека взаимодействуют с вирусом в течение его жизненного цикла. Основное внимание в исследовании уделяется пониманию эволюции вируса и его последствий как для разработки лекарственного средства, так и для поиска лекарства от его устранения или полного подавления вируса в организме человека. Была выражена благодарность за важный вклад, который добровольцы World Community Grid внесли в работу Центра ВИЧE.
Рисунок 1. Участники встречи ВИЧ-инфицированных лицом к лицу,
Январь 2020, Ла Холья, Калифорния
Рисунок 2. Группа FAAH на собрании HIVE (слева направо): Рон Леви, Арт Олсон, Джулия Бьянко, Авик Бисвас, Нанджи Дэн, Циньфан Сунь, Стефано Форли
Ссылки
https://www.scripps.edu/hive_center/index.html
https://www.worldcommunitygrid.org/research/faah/overview.do
https://ronlevygroup.cst.temple.edu/levygroup_people.html
http://mgl.scripps.edu/projects
Ну, если ни кто не против то я буду постить переводные гуглом статьи, во все темы которые они относятся...
вот очередная статья...
Команда World Community Grid's FightAIDS @ Home собралась на совещании Центра HIVE
Автор: исследовательская группа FightAIDS @ Home
Резюме 11 февраля 2020 г.
Исследователи FightAIDS @ Home недавно встретились в Калифорнии, чтобы обсудить свои планы на будущее проекта.
15 и 16 января 2020 года Центр ВИЧE (ВИЧ-взаимодействия в процессе вирусной эволюции) провел свою ежегодную зимнюю встречу лицом к лицу в Ла-Холье, штат Калифорния, в Исследовательском институте Скриппса. Шестьдесят пять ученых, являющихся членами HIVE со всей страны, присутствовали. Этот финансируемый Национальным институтом здравоохранения США центр был основан директором-основателем профессором Артуром Олсоном, который также инициировал проект FightAIDS @ Home (FAAH) по сетке World Community Grid (WCG) в 2005 году. FAAH и WCG играют важную роль в работе Центра, который объединяет их вычислительные исследования с экспериментальными исследованиями вирусологов, молекулярных биологов, структурных биологов и химиков в рамках HIVE.
На собрании было представлено последнее исследование группы FAAH, в которое вошли работы группы Леви из Университета Темпл, а также лаборатории Олсона в Исследовательском институте Скриппса.
Группа Леви описала текущие вычисления, которые они делают, чтобы найти новые лекарственные препараты-кандидаты. Они используют World Community Grid для оценки и ранжирования соединений, которые были ранее идентифицированы путем виртуального скрининга на молекулу капсида и его сборки. Капсид является новой мишенью ВИЧ для разработки лекарств, и эта новая мишень имеет решающее значение в процессе вирусной инфекции.
Группа Олсона описала новые предварительные виртуальные экраны против капсида, которые могут создавать «ингибиторы самоубийства», соединения, химически связанные с целевым белком. В этом подходе используется химия, разработанная для члена HIVE и лауреата Нобелевской премии Барри Шарплса в Scripps. Обсуждались планы запуска новой виртуальной кампании скрининга с использованием этой химии против капсида на FightAIDS @ HOME.
На двухдневной встрече была освещена последняя работа HIVE по пониманию структуры и функции ВИЧ и того, как инфицированные клетки человека взаимодействуют с вирусом в течение его жизненного цикла. Основное внимание в исследовании уделяется пониманию эволюции вируса и его последствий как для разработки лекарственного средства, так и для поиска лекарства от его устранения или полного подавления вируса в организме человека. Была выражена благодарность за важный вклад, который добровольцы World Community Grid внесли в работу Центра ВИЧE.
Рисунок 1. Участники встречи ВИЧ-инфицированных лицом к лицу,
Январь 2020, Ла Холья, Калифорния
Рисунок 2. Группа FAAH на собрании HIVE (слева направо): Рон Леви, Арт Олсон, Джулия Бьянко, Авик Бисвас, Нанджи Дэн, Циньфан Сунь, Стефано Форли
Ссылки
https://www.scripps.edu/hive_center/index.html
https://www.worldcommunitygrid.org/research/faah/overview.do
https://ronlevygroup.cst.temple.edu/levygroup_people.html
http://mgl.scripps.edu/projects