Проект Rosetta@Home
Цитата: DimOK от 03.10.2021, 15:14Почему промежуточные результаты сохраняются только через 3 с половиной часа, если в настройках указано каждые 10 минут? Время расчета заданий стандартное - 8 часов. Раньше такого не было.
Почему промежуточные результаты сохраняются только через 3 с половиной часа, если в настройках указано каждые 10 минут? Время расчета заданий стандартное - 8 часов. Раньше такого не было.
Цитата: DimOK от 10.10.2021, 10:57Проблема с чекпойнтами исчезла - результаты теперь сохраняются каждые 10 минут.
Кто-нибудь знает товарища под ником Andrey_ns? У него 231 хост. Просто интересно, откуда у него доступ к такому количеству компьютеров. Это надо работать, скажем, в одном из отделений РАН, чтобы запустить Розету на всех имеющихся там компьютерах.
Из 231 хостов 183 построены на базе старых процессоров AMD Athlon(tm) X4 840 Quad. Наверно, это и вправду какой-нибудь научный институт.
Проблема с чекпойнтами исчезла - результаты теперь сохраняются каждые 10 минут.
Кто-нибудь знает товарища под ником Andrey_ns? У него 231 хост. Просто интересно, откуда у него доступ к такому количеству компьютеров. Это надо работать, скажем, в одном из отделений РАН, чтобы запустить Розету на всех имеющихся там компьютерах.
Из 231 хостов 183 построены на базе старых процессоров AMD Athlon(tm) X4 840 Quad. Наверно, это и вправду какой-нибудь научный институт.
Цитата: Удаленный пользователь от 10.10.2021, 13:23Цитата: DimOK от 10.10.2021, 10:57Проблема с чекпойнтами исчезла - результаты теперь сохраняются каждые 10 минут.
Кто-нибудь знает товарища под ником Andrey_ns? У него 231 хост. Просто интересно, откуда у него доступ к такому количеству компьютеров. Это надо работать, скажем, в одном из отделений РАН, чтобы запустить Розету на всех имеющихся там компьютерах.
Из 231 хостов 183 построены на базе старых процессоров AMD Athlon(tm) X4 840 Quad. Наверно, это и вправду какой-нибудь научный институт.
тоже интересно...
Цитата: DimOK от 10.10.2021, 10:57Проблема с чекпойнтами исчезла - результаты теперь сохраняются каждые 10 минут.
Кто-нибудь знает товарища под ником Andrey_ns? У него 231 хост. Просто интересно, откуда у него доступ к такому количеству компьютеров. Это надо работать, скажем, в одном из отделений РАН, чтобы запустить Розету на всех имеющихся там компьютерах.
Из 231 хостов 183 построены на базе старых процессоров AMD Athlon(tm) X4 840 Quad. Наверно, это и вправду какой-нибудь научный институт.
тоже интересно...
Цитата: DimOK от 29.11.2021, 16:43Администратор проекта дал разъяснения по поводу заданий, требующих VirtualBox, а значит, и много памяти (пост от 20 сентября 2021 года):
"Эта первая крупная партия VM-заданий (VM – virtual memory – виртуальная память) от "rosetta_python_projects", но мы надеемся, что в будущем их станет еще больше. Поскольку это наша первая попытка использовать доступную в BOINC VM-опцию, у нас несомненно появится много трудностей, которые нам предстоит решать в процессе работы. Пожалуйста, проявите терпение – ведь мы уже над ними работаем. Наше стандартное приложение Rosetta по-прежнему используется, однако число доступных для него заданий может варьироваться, как и раньше – это зависит от требований к вычислительным ресурсам, которые предъявляются нашими исследователями.
VM-функция счетного приложения предоставляет исследователям более гибкие возможности для работы с научным программным обеспечением, что было бы невозможно в рамках Rosetta@home. Например, приложение "rosetta_python_projects" позволяет ученым запускать модели прогнозирования структуры белков, в том числе RoseTTAFold и AlphaFold2, основанные на глубоком обучении, а также другие написанные на языке Python пакеты программного обеспечения, такие как AIMNet, которые используются в текущей партии VM-заданий, чтобы минимизировать возможные нарушения микроциклов".
Администратор проекта дал разъяснения по поводу заданий, требующих VirtualBox, а значит, и много памяти (пост от 20 сентября 2021 года):
"Эта первая крупная партия VM-заданий (VM – virtual memory – виртуальная память) от "rosetta_python_projects", но мы надеемся, что в будущем их станет еще больше. Поскольку это наша первая попытка использовать доступную в BOINC VM-опцию, у нас несомненно появится много трудностей, которые нам предстоит решать в процессе работы. Пожалуйста, проявите терпение – ведь мы уже над ними работаем. Наше стандартное приложение Rosetta по-прежнему используется, однако число доступных для него заданий может варьироваться, как и раньше – это зависит от требований к вычислительным ресурсам, которые предъявляются нашими исследователями.
VM-функция счетного приложения предоставляет исследователям более гибкие возможности для работы с научным программным обеспечением, что было бы невозможно в рамках Rosetta@home. Например, приложение "rosetta_python_projects" позволяет ученым запускать модели прогнозирования структуры белков, в том числе RoseTTAFold и AlphaFold2, основанные на глубоком обучении, а также другие написанные на языке Python пакеты программного обеспечения, такие как AIMNet, которые используются в текущей партии VM-заданий, чтобы минимизировать возможные нарушения микроциклов".