TN-Grid Platform
Vespucci-2023 Vitis vinifera OneGenE официально начат.
Виноградная лоза (виды Vitis) является одной из наиболее важных плодовых культур с точки зрения посевной площади и экономического воздействия, а также из-за большой потребности в пестицидах. Несмотря на эту актуальность, мало что известно о молекулярных регуляторных цепях, лежащих в основе физиологии этого вида. Очевидно, что более глубокое знание биологии виноградной лозы окажет положительное влияние на методы управления и селекцию, что в конечном итоге приведет к более устойчивому виноградарству.
Мы только что начали два эксперимента (генная экспансия) на двух разных наборах данных (rna seq, riboseq). В общей сложности будет около 140 тыс. рабочих единиц (2 задачи), каждая относительно быстрая, распределенная пакетами.
Если вы заинтересованы, пожалуйста, следите за обсуждением здесь: https://gene.disi.unitn.it/test/forum_thread.php?id=384
Новые задания пошли. M. musculus 'OneGenE'. Этот эксперимент направлен на выявление генных сетей, включающих мышиные гены, имеющие медицинское значение для спинальной мышечной атрофии, нейродегенеративного заболевания, представляющего собой наиболее распространенную генетическую причину детской смертности.